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Dirigido a usuarios de microscopía avanzada que deseen obtener mayor rendimiento de sus equipos, mejorar la calidad de las imágenes y obtener resultados cuantitativos de las mismas.
Es un seminario fundamentalmente práctico, donde se abordará, entre otros métodos, los procedimientos básicos para el realce y la restauración de las imágenes, la eliminación del ruido de fondo de muestras procedentes de microscopía convencional y confocal, la preparación de máscaras para la cuantificación y el análisis de imagen semiautomático y la reconstrucción tridimensional a partir de secciones ópticas y cortes histológicos.
Todo el software que se utilizará en el curso será libre y se facilitará a los participantes durante el mismo (ImageJ y Fiji).
Profesor:
 Dr. José F. Pertusa-Grau (Universitat de València, España). |
 Dr. Soledad De Esteban-Trivigno (Transmitting Science, Spain). |
Graduado o Postgraduado en cualquier grado de Ciencias, conocimientos básicos de Estadística y de informática. Ordenador portátil (Windows, Mac, Linux).
Castellano.
Instalaciones de Sabadell del Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont, C/ de l’Escola Industrial, 23, 08201 Sabadell, Barcelona (España). Cómo llegar.
1. Métodos manuales para la obtención de medidas. Estereología. Qué medir y cómo. Estimación del área. Estimación de la longitud de un objeto. Estimación del error de la medida. Inferencia de la tercera dimensión: métodos estereológicos; cálculo de volumen, superficie y densidad de objetos en estructuras tridimensionales.
2. Análisis de imagen asistido por ordenador. La imagen analógica y la imagen digital. Conversión analógica-digital: el píxel. Convenios en análisis de imagen. Parámetros de campo y de objeto. Parámetros densitométricos. Nivel de gris: el histograma de gris. Escalado lineal. Procedimiento general en análisis de imagen asistido por ordenador.
3. Procesado de imagen (I): Operaciones punto a punto. Tablas de conversión de gris (LUT). Falso color. Alteraciones del histograma de gris: normalización y ecualización. Operaciones aritméticas entre imágenes en gris. Problemas de la manipulación de grises para la medida de parámetros.
4. Procesado de imagen (II): Operaciones de vecindad. Concepto de Kernel. Filtros de suavizado y enfatizado. Operaciones matemáticas para detectar márgenes: el operador cruzado de Roberts. Los operadores matriciales Sobel y Kirsch. Otros detectores de márgenes.
5. Segmentación. Técnicas de Segmentación: segmentación manual, segmentación por umbrales, otras técnicas de segmentación. La imagen binaria y sus propiedades.
6. Operaciones con imágenes binarias. Morfología Matemática. Algoritmos básicos: erosión, dilatación apertura, cierre. Algoritmos clásicos: Border-Kill y Hole-Fill. Reconstrucción de imágenes degradadas. Algoritmos de esqueletizado, adelgazamiento y crecimiento. Operaciones booleanas con imágenes binarias: aplicaciones. Determinación de errores en operaciones sobre imágenes binarias.
7. La imagen 3D. Series de imágenes según su procedencia: cortes seriados, microscopio confocal, imagen de tomografía. Preparación de pilas de imágenes a partir de imágenes independientes; formato del archivo de la pila de imagen. Reconstrucción de imagen 3D desde cortes ópticos y pilas de imágenes.
8. Resolución de problemas concretos: Análisis estereológico. Corrección de errores en la captación de imagen: sombreado y ruido de fondo. Medidas de parámetros densitométricos de objeto: segmentación y aplicación de máscaras. Medidas de parámetros morfométricos: segmentación, aplicación de máscaras y clasificación de objetos.
30 horas presenciales.
De lunes a viernes:
De 9:30 a 13:30: Clase.
De 13:30 a 15:00: Comida.
De 15:00 a 17:00: Clase.
- Todos los días habrá una pausa para el café durante las clases de la mañana.
La capacidad del curso es de 20 participantes, que se ocuparán por estricto orden de inscripción.
Precio reducido hasta el 31 de octubre de 2013: 375 €. Precio completo a partir del 1 de noviembre de 2013: 525 €. El precio incluye el material del curso, los cafés y las comidas.
Los antiguos participantes tendrán un descuento del 5% sobre el precio actual del curso.
Ofrecemos la posibilidad de pagar en dos plazos (contáctenos en courses@transmittingscience.org).
Para realizar la inscripción debe rellenar el Formulario de Inscripción que aparece debajo; confirmaremos su aceptación por e-mail.
Política de cancelaciones:
Las cancelaciones por parte de los participantes hasta 20 días antes de la fecha de inicio del curso, tendrán un cargo por cancelación del 30% de la matrícula. Para cancelaciones posteriores o no asistencia, se cargará la matrícula completa del curso.
Si Transmitting Science debe cancelar el curso debido a circunstancias imprevistas fuera del control de Transmitting Science, los participantes tendrán derecho al reembolso total de la matrícula; o esta matrícula podrá ser guardada para un curso/workshop futuro. Transmitting Science no se responsabilizará de los de gastos de viaje, o de cualquier otro gasto incurrido por los participantes debidos a dicha cancelación. Transmitting Science hará todo lo posible para evitar cualquier cancelación.
El curso tendrá lugar en la ciudad de Sabadell, Barcelona (España).
Puede alojarse en Barcelona o en Sabadell. Información sobre Hoteles y Hostal en Sabadell aquí.
Cómo llegar a Sabadell desde Barcelona.
Desafortunadamente no hay becas internas disponibles para este curso. Para obtener información sobre Ayuda Financiera Externa, por favor consulte el enlace.
Para cualquier información adicional: courses@transmittingscience.org.
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